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MeRIP-seq

产品介绍常见问题经典案例结果展示


MeRIP-seq 全面高效分析 mRNA 的 m6A 修饰情况

RNA甲基化免疫共沉淀 (Methylated RNA Immunoprecipitation,MeRIP)基于 m6A 特异性抗体识别并结合 mRNA 上 m6A 的原理,以 RNA 免疫共沉淀方法富集甲基化修饰片段为基础,并联合高通量测序,研究发生 m6A 甲基化修饰的 mRNA 区域。

全面、高效、性价比高

RNA 修饰能够在转录后水平上调控 RNA 的稳定性、定位、运输、剪切和翻译,因此 MeRIP 有助于在癌症发生和转移、胚胎发育、脂类代谢、环状 RNA 翻译和 DNA 损伤修复等生物学功能和作用机制方面的研究。具有“全面、高效、性价比高”的优势,已广泛应用于人、大鼠、小鼠、猪、拟南芥等物种的研究。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源 MeRIP 测序项目对
IP 实验合格的 RNA 样本建库
测序,获得高质量 reads,通
过 motif 分析判断 IP 的特异
性以及分析的可信性,高效预
测相关基因,进行功能富集分
析,构建m6A修饰图谱。

MeRIP-seq 分析内容 解决问题
标准分析 测序数据质量评估 过滤掉低质量数据,保证数据质量
参考序列比对分析 唯一比对的 reads 分布统计
Peak calling 检出发生 m6A 修饰的可信区域
Motif 分析 蛋白结合序列的偏好性
Peak 峰相关基因注释 Peak 在基因组及转录本
功能区上的分布
差异 peak 分析 分析不同样本间差异 peak 峰
相关基因功能分析 Peak 相关基因 GO,
KEGG 富集分析
个性化分析、多组学关联分析需联系产品经理进行评估。

悦读高质量测序数据,尽享 HPC 澎湃动力

MeRIP 测序采用先进的 Illumina 测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用 DELL 计算节点和 Isilon 存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

诺禾致源已经成功完成对人、猪,拟南芥等物种进行 MeRIP 测序分析,助力客户在 Hepatology 等权威杂志发表多篇高水平文章。“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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