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比较转录组与泛转录组测序

产品介绍常见问题经典案例结果展示


比较转录组与泛转录组测序

产品介绍常见问题经典案例结果展示


借转录组研究之力解秘物种进化

比较转录组测序是基于Illumina测序平台,通过RNA-seq技术手段研究物种进化,
通过不同物种或亚种间mRNA序列差异进而分析近源物种间的亲缘关系,
挖掘明显受到正向选择或负向选择的基因。泛转录组测序不仅能分析比较转录组的内容,
同时还可以构建共表达网络,挖掘关键基因模块。

高效,精准,超值。

比较转录组与泛转录组测序是一种快速、全面解析不同品系、
不同亚种进化关系及特定组织表达情况的生物学方法,以期从序列水平
和基因表达水平发掘物种进化历程。 具有“高效、基因定位准、超值”的优势,
已广泛应用于水稻、拟南芥、番茄等物种的进化研究。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源比较转录组与泛转录组测序,通过对样本的转录本进行单独拼
接,筛选直系同源基因,研究进化关系,挖掘主效基因集。

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分析内容
转录本拼接
直系同源基因查找
直系同源基因Ka/Ks分析
PCA分析
系统进化树构建
表达水平进化分析(泛转录组特有)
共表达网络模块构建(泛转录组特有)

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

比较转录组与泛转录组采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2015年12月,诺禾致源已经成功对番茄、苎麻、裂腹鱼、蛙、
沙拐枣、枸杞、核桃、黄岑等30多个物种进行比较转录组或泛转录组测序分析,
已在Plant Molecular Biology等权威期刊发表多篇研究成果。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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